Fue por esta razón que el Campus Cozumel destacó desde el primer momento: por su innovación en la formación profesional, al incluir en su oferta este tipo de programas educativos de Profesional Asociado (Nivel 5 de la UNESCO), pensados en áreas de demanda especifica de las necesidades del desarrollo económico en la Isla, con un programa de estancias profesionales que facilitarían a los egresados una inserción al mundo laboral. Ahora las otrora prácticas profesionales forman parte de la mayoría de los programas educativos de educación superior en todo el país.

Al ser un Campus que surge por una fuerte demanda social de los habitantes de Cozumel, quienes pedían Educación Superior, se exigió la creación de Licenciaturas. Así, es como llegan las licenciaturas en Lengua Inglesa, Sistemas Comerciales, que ya se ofrecían en el Campus Chetumal, y se completa con Turismo, que sólo se ofrecía en Cozumel.

A estas licenciaturas se le suman en el año 2000 tres nuevos programas: los profesionales asociados en Recursos Humanos y en Cómputo Informático, y la Licenciatura en Cómputo Informático, que por sus competencias se transformarían en 2004 en Profesional Asociado en Tecnologías de Información y la Licenciatura en Tecnologías de Información. En 2005 se abre la última licenciatura que se sumó a la oferta educativa de este Campus: Manejo de Recursos Naturales.

Pocos años después, los profesionales asociados salen de la oferta educativa del Campus Cozumel y también la Licenciatura en Tecnologías de la Información, con lo que, de 11 programas se reduce la oferta a sólo cuatro licenciaturas, cuyos programas se han actualizado, pasando de Turismo a Gestión de Servicios Turísticos; de Sistemas Comerciales a Mercadotecnia y Negocios, además de actualizaciones en los planes de estudio de Lengua Inglesa y Manejo de Recursos Naturales, manteniéndoles a la vanguardia.

Con un claustro académico fuerte, que se consolida con el tiempo, con un gran número de doctores, muchos de ellos parte del Sistema Nacional de Investigadores e Investigadoras, se trabaja en la creación de posgrados, llegando primero la Maestría en Gestión Sustentable del Turismo, hoy en reconstrucción, y el Doctorado en Desarrollo Sostenible.

Asimismo, actualmente se ofrece una maestría en Ciencias Marinas y Costeras, con lo que no sólo se fortaleció la oferta educativa de este Campus, sino que –a 26 años de su creación— es un referente regional en la investigación en Desarrollo Sustentable, Turismo, Negocios, Educación e Identidad.

El reto de la División de Desarrollo Sustentable —máximo órgano académico del Campus Cozumel— es ampliar y fortalecer su oferta educativa, por lo que espera llegar a los 30 años con una renovada oferta, referente de investigación en la región, y la principal formadora de los profesionistas que demanda Cozumel y Quintana Roo.